提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
外媒聚焦二十大:中国在发展征程中与其他国家同行******
中新网10月20日电 连日来,国际媒体关注中共二十大报告热度不减。就报告中提出的“促进世界和平与发展,推动构建人类命运共同体”等相关表述,国际舆论普遍认为,中国要在发展征程中与其他国家同行,中国的新发展不断为世界提供新机遇,为各国人民带来更多福祉。
10月16日,中国共产党第二十次全国代表大会在北京人民大会堂隆重开幕。 中新社记者 蒋启明 摄维护世界和平宗旨不变
近日,“和平外交政策”“高水平对外开放”等中共二十大报告中的表述成为国际舆论场热词。俄罗斯自由媒体网站关注到,报告指出,中国始终坚持维护世界和平、促进共同发展的外交政策宗旨,坚决反对一切形式的霸权主义和强权政治。
南非独立在线新闻网站则关注到,中共二十大报告中指出,中国始终坚持维护世界和平、促进共同发展的外交政策宗旨,致力于推动构建人类命运共同体。报告还呼吁世界各国弘扬和平、发展、公平、正义、民主、自由的全人类共同价值,促进各国人民相知相亲,共同应对各种全球性挑战。
津巴布韦《先驱报》刊发对该国新闻部长兼政府发言人穆茨万古瓦的专访。穆茨万古瓦回顾了多年来中国在支持多边主义,维护全球和平和安全方面所作出的贡献。她指出,中国已成为全球致力于推动和平解决冲突的主要声音之一。
俄罗斯卫星通讯社在专家采访报道中指出,中国将坚持构建人类命运共同体,推进全球发展倡议和全球安全倡议落地落实,未来还将推进其他人类共同价值的全球性建设,包括公平、正义、民主、自由。中国未来的话语体系将不仅富有中国特色,且极具全球通约性。
“高水平对外开放”成热词
俄新社通过对专家的采访,对二十大报告中提到的高水平对外开放进行了阐述。专家分析称,报告中“开放”一词多次出现。实施更加积极的对外开放战略,必须坚定不移地奉行共赢的开放战略。中国的新发展,不断为世界提供新机遇,推动建设开放型世界经济,为各国人民带来更多福祉。
报道称,二十大报告清晰描述了中国对外开放未来路线图。保持高水平对外开放,也是加快构建新发展格局、贯彻新发展理念的重要内容。
《巴基斯坦观察家报》指出,中国要在发展征程中与其他国家同行。中国提出的“一带一路”倡议就是为了实现共同繁荣的目标。越来越多的国家正在加入这一倡议,足以见得该倡议的成功。
报道还表示,“我们祝愿中国人民在未来的岁月里取得更多的成就,同时也希望我们的政治领导人学习中国模式,挖掘这个国家的真正潜力。”
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |